بالتأكيد. تكنولوجيا mNGS (التسلسل الميتاجينوميكي الجيل القادم) يمكنها اكتشاف الحمض النووي والحمض النووي الريبوزيني في وقت واحد، وهي واحدة من أهم مزاياها على طرق الاختبار التقليدية.غالبًا ما يشار إلى هذا المزيج من الاختبارات لكل من مسببات الأمراض الحمض النووي والحمض النووي باسم mNGS (لمسببات الأمراض الحمض النووي) + RNA-Seq (لمسببات الأمراض الحمض النووي)، وفي الممارسة السريرية، غالبا ما يشار إليها مجتمعة باسم "تسلسل المسببات المرضية".

يوضح ما يلي مبادئه ومزاياه وحالات تطبيقه بالتفصيل:

1كيفية تحقيق الكشف المشترك للحمض النووي والحمض النووي النووي؟

الاكتشاف المشترك ليس مجرد مسألة إلقاء عينة في آلة؛ فإنه يتطلب عملية مختبرية محددة:

استخراج حمض النووي العين: أولاً، يتم استخراج حمض النووي الكلي (بما في ذلك الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي) من العينات السريرية (مثل الدم، السائل النخاعي،و سائل غسيل القصبة الدموية) باستخدام مجموعة استخراج متخصصة.

النسخ العكسي (الخطوة الرئيسية): يتم إضافة النسخ العكسي إلى الحمض النووي الكلي المستخرج لنسخ العكسي لجميع الحمض النووي الريبوزي (الإنساني والمرضي) إلى الحمض النووي التكميلي (cDNA).

بناء المكتبة التسلسلية: في هذه المرحلة يتم تحويل جميع المواد الوراثية في العينة إلى الحمض النووي (الحمض النووي الأصلي + الحمض النووي المضاف إلى الوراء من الحمض النووي الريبوزي). ثم يتم تجزئة هذا الحمض النووي ، وإضافة محول ،ويتم معالجتها باستخدام مجموعة بناء المكتبة العالمية لبناء مكتبة جاهزة للتسلسل.

تسلسل البيانات عالية النطاق وتحليل المعلوماتية الحيوية: بعد تسلسل المكتبة عالية النطاق ، تخضع الكمية الهائلة من البيانات المولدة لخطوط أنابيب المعلوماتية الحيوية المتخصصة:

إزالة التسلسل البشري: يتم محاذاة التسلسلات التي تنتمي إلى الجينوم البشري وتصفيتها للحد من حجم البيانات وتحسين الحساسية التحليلية.

مقارنة تصنيفية: يتم مقارنة التسلسلات المتبقية مع قاعدة بيانات واسعة من الكائنات الدقيقة المسببة للأمراض (بما في ذلك البكتيريا ، فيروسات الحمض النووي ، فيروسات الحمض النووي ، الفطريات ، الطفيليات ، وأكثر من ذلك).

إنتاج التقارير: يتم إنشاء تقرير، يدرج جميع مسببات الأمراض المشتبه فيها المكتشفة (بما في ذلك فيروسات الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي) ويوفر معلومات ذات صلة عن عدد القراءات.

2المزايا الكبيرة لاختبار الحمض النووي والحمض النووي المشترك

الطيف الواسع والفرضيات الخالية: بإزالة الحاجة إلى مسببات الأمراض المحددة مسبقاً، يمكن لاختبار واحد فحص جميع مسببات الأمراض المحتملة في العينة، بما في ذلك الفيروسات غير المعروفة والنادرة والناشئة (مثل.g.، سارس-كوف-2 والفيروسات البونيا الجديدة، التي تم اكتشافها من خلال هذه التكنولوجيا).

فعالة وشاملة: يمكن أن يغطي اختبار واحد جميع مسببات الأمراض تقريبًا ، مما يجعله مناسبًا بشكل خاص للتشخيص السريع للأسباب في المرضى الحرجين ، الصعب تشخيصهم ، العدوى المختلطة ،والمرضى الذين يعانون من انخفاض المناعة، وتجنب عملية الاختبار التقليدية "واحد تلو الآخر" التي تستغرق وقتا طويلا.

اكتشاف مسببات الأمراض غير المتوقعة: غالبًا ما يتم اكتشاف مسببات الأمراض التي لم تُعتبر في السابق سريريًا، مما يوفر رؤى تشخيصية جديدة.

3سيناريوهات التطبيق الرئيسية

هذه التكنولوجيا عادة لا تكون الخيار الأول، ولكنها تلعب دورا رئيسيا عندما لا يمكن للطرق التقليدية تحديد السبب بوضوح:

الحمى من أصل غير معروف (FUO)

عدوى داخل الجمجمة من أصل غير معروف (مثل التهاب السحايا، التهاب الدماغ)

الالتهاب الرئوي من أصل غير معروف (وخاصة في المرضى المصابين بأمراض حرجة أو المرضى الذين يعانون من ضعف المناعة)

التشخيص الأساسي للصدمة السبتية

تشخيص العدوى الانتهازية

4القيود

تكلفة عالية: تسلسل البيانات وتحليلها مكلف.

متطلبات تقنية عالية: تتطلب أجهزة مختبر عالية للغاية وإجراءات تشغيلية وقدرات تحليل المعلوماتية الحيوية.

صعوبة التمييز بين الاستعمار والعدوى: اكتشاف تسلسل ميكروبي لا يضمن أنه هو الجاني.يجب على الأطباء إجراء تقييم شامل بناءً على أعراض المريض، والعلامات، ونتائج الاختبار الأخرى.

مشاكل الحساسية: قد تفشل بعض العينات ذات الحمولة المنخفضة للمسببات الأمراضية في الكشف عنها.

باختصار، تتيح تكنولوجيا mNGS، من خلال الخطوة الرئيسية "النسخ العكسي"، بنجاح الكشف في وقت واحد عن كل من مسببات الأمراض الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي. It is a powerful and unbiased pathogen screening tool that plays an irreplaceable role in the diagnosis of difficult and critical infections and is an important advancement in modern medical diagnostic technology.