اختبار طفرة الجينات PDGFRA: تحديد المجموعة الفرعية للورم التي تترك اختبار KIT وراءها

نظرة عامة

لا يتم تشغيل كل ورم قاعي بواسطة KIT، والمرضى الذين لا ينتمون إلى هذه المجموعة هم بالضبط السبب في طلب تحديد النمط الجيني لـ PDGFRA. هذه القطعة تقترب من الاختبار كمسألة سكانية:أي الأورام تحمل متغيرات PDGFRA، حيث في الجسم هذه الأورام تميل إلى الظهور، وكيف ينبغي أن يحدد التقرير المجموعة الفرعية بحيث يمكن للأطباء العمل عليها.

كيف يعمل

ينتمي PDGFRA إلى نفس عائلة المستقبلات مثل KIT ويقوم بإعادة إرسال إشارات نمو مماثلة من خلال مجال الكينازات داخل الخلية. تركز التغيرات المنشطة في ثلاث مناطق:الذي يرمز حلقة التنشيط ويحتوي على بديل D842V الملاحظ بشكل متكرر؛ إكسون 12، تغطي منطقة الغشاء المختلط؛ وإكسون 14، تغطي جزء من نطاق الكيناز. لأن هذه المواقع تختلف عن نقاط الساخنة كيت،طلب KIT فقط يعيد نتيجة سلبية في هذه المجموعة الفرعية على الرغم من وجود عامل حقيقي على مستوى المستقبلتسلسل PDGFRA جنبا إلى جنب أو مباشرة بعد KIT يغلق هذه الفجوة ويعيد تصنيف الأورام التي كانت تسمي سابقاً بـ "غير معروفة".

مؤشرات

المجموعة الفرعية التي تستحق إعطاء الأولوية تميزت بشكل جيد: الأورام القصبية التي تم الإبلاغ عنها على أنها من النوع البري KIT ، والآفات التي تنشأ في المعدة أو العظم ،والحالات التي تظهر شكلها البصري تحت المجهرعندما يكون النسيج نادرًا ويكون اختبارًا آخر واحدًا فقط واقعيًا ، فإن هذه الخصائص تحدد المرضى الأكثر عرضة لإعطاء نتيجة PDGFRA المفيدة.يستخدم الاختبار للتصنيف الجزيئي للورم ويجب تفسيره جنبا إلى جنب مع علم النسيج وليس في عزلة.

المواصفات والتقارير

الأنسجة المثبتة بالفورمالين هي المدخل القياسي، مع تأكيد الخلايا الورمية في المختبر قبل الاستخراج.و يجب أن يطلب التقرير إكتشاف إكسون 18 D842V بشكل صريح بدلاً من طيّه إلى فئة عامة من الإكسون 18، لأن هذا الاستبدال المحدد يحدد مجموعة فرعية متميزة داخل المجموعة الفرعية. فصيلة الأليل المتغيرة ، والنتيجة البروتينية المتوقعة وحد الاكتشاف في الاختبار يكملون تقريرًا قابلًا للاستخدام.

التخزين والمصادر

عندما تتبع PDGFRA طلب KIT باعتبارها اختبار رد فعل ، فإن القيود العملية هي الأنسجة المتبقية بدلاً من درجة الحرارة.تأكيد مع المختبر عدد الأقسام التي يمكن أن تدعمها كتلة واحدة وما إذا كان يتم الاحتفاظ بالحمض النووي المستخرج لطلبات التداول، حيث أن إعادة قطع كتلة منتشية غالباً ما يكون مستحيلاً. تتحرك الكتل في درجة حرارة الغرفة ، بينما يتم أرشفة حمض النوكلييك المتبقي مجمد.الاتفاق على معايير رد الفعل مسبقا يتجنب طلب عينة ثانية قد لا يكون المريض قادرا على توفير.

الأسئلة الشائعة

س: أي المرضى يجب إعطائهم الأولوية لتحليل PDGFRA عندما تكون الأنسجة محدودة؟إعطاء الأولوية لحالات KIT النوع البري ، والأورام الأساسية المعدنية أو الجذعية ، والأورام ذات الخصائص البثرية.هذه الخصائص تركز على إنتاج التشخيص عندما لا يمكن سوى قطع إضافية واحدة.

السؤال: لماذا يتم تحديد بديل الإكسون 18 D842V في التقارير؟إنه التغيير الأكثر شيوعاً في PDGFRA ويتصرف كفئة جزيئية خاصة به ، لذلك فإن تجميعه تحت عنوان عام للأكسون 18 يرفض التمييز الذي يجعل النتيجة قابلة للتنفيذ.

س: هل يغير الاكتشاف الإيجابي لـ PDGFRA كيفية تصنيف الورم؟إنه ينقل الحالة من حالة غير معروفة إلى نوع جزيئي محدد. التشخيص التشريحي قائم، ولكن التصنيف الجزيئي والسكان المريض ينتمي إلى كل من التغيير.